Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AQP4P55087 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AQP4P55087 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms