Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARFIP1P53367 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms