Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms