Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms