Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SMARCA4P51532 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMARCA4P51532 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms