Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERFP50548 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERFP50548 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERFP50548 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERFP50548 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms