Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms