Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM1P49642 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms