Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYB561P49447 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYB561P49447 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYB561P49447 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYB561P49447 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYB561P49447 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms