Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCT3P49368 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCT3P49368 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCT3P49368 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCT3P49368 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCT3P49368 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCT3P49368 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCT3P49368 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCT3P49368 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCT3P49368 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms