Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTRNP46939 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTRNP46939 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTRNP46939 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTRNP46939 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms