Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETFBP38117 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETFBP38117 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETFBP38117 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms