Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2IP36954 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms