Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPB2P35606 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPB2P35606 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms