Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms