Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPC1P35052 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC1P35052 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPC1P35052 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms