Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms