Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUSP1P28562 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUSP1P28562 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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DUSP1P28562 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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