Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD1P28340 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD1P28340 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLD1P28340 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLD1P28340 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD1P28340 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms