Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms