Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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