Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2AP24928 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms