Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CA6P23280 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CA6P23280 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CA6P23280 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CA6P23280 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms