Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSR1P21757 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSR1P21757 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSR1P21757 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms