Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms