Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms