Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DESP17661 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DESP17661 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DESP17661 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms