Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms