Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPGDP15428 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPGDP15428 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPGDP15428 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPGDP15428 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms