Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRF1P14222 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRF1P14222 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRF1P14222 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms