Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms