Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GLI4P10075 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms