Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13BP05160 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13BP05160 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13BP05160 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13BP05160 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13BP05160 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F13BP05160 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F13BP05160 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
F13BP05160 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13BP05160 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13BP05160 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms