Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF253O75346 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF253O75346 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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