Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms