Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX4O60224 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX4O60224 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SSX4O60224 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX4O60224 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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