Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms