Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEF1E1O43324 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms