Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLOCKO15516 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms