Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms