Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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