Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms