Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FER1L4A9Z1Z3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms