Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NL46 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NL46 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NL46 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms