Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms