Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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