Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms