Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRXN3Q9Y4C0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms