Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms