Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms